Cuenta con características avanzadas que permiten propagar eliminaciones de ficheros (siempre y cuando hayan sido sometidos previamente a un proceso de sincronización y formen parte del registro del programa).
Puede sincronizar ficheros y directorios ocultos, así como hacer una copia de seguridad de los ficheros reemplazados que se puede recuperar más adelante.
Otras de las funciones estrella del programa se denomina 'Detección de colisiones' o lo que es lo mismo: si hay un fichero que ha sido modificado en más de un directorio, se pregunta al final de operación por cuál queremos conservar.
Synkron también permite programas los trabajos de sincronización para que se realicen de forma periódica.
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